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Titelaufnahme

Titel
Molecular modeling and computational investigation of targets within the inflammatory cascade / vorgelegt von Veronika Sophie Temml
VerfasserTemml, Veronika Sophie
Begutachter / BegutachterinSchuster, Daniela Brigitte ; Kubinyi, Hugo
Betreuer / BetreuerinSchuster, Daniela Brigitte ; Rollinger, Judith Maria
Erschienen2014
Umfang240 S. : 1 DVD+R ; zahlr. Ill., graph. Darst.
HochschulschriftInnsbruck, Univ., Diss., 2014
Anmerkung
Enth. u.a. 9 Veröff. d. Verf. aus den Jahren 2012 - 2014
Datum der AbgabeJuli 2014
SpracheEnglisch
Bibl. ReferenzOeBB
DokumenttypDissertation
Schlagwörter (DE)Virtuelles Screening / Pharmacophore / Docking / Inflammation / Entzündung / 5-Lipoxygenase / Cyclooxygenase / Liver X receptor / Indolamin-2,3-dioxygenase / 5-Lipoxygenase Activating Protein / soluble epoxide hydrolase / Wirkstoffdesign
Schlagwörter (EN)virtual screening / Pharmacophore / Molecular modeling / Inflammation / 5-Lipoxygenase / Cyclooxygenase / Liver X receptor / Indoleamine-2,3-dioxygenase / 5-Lipoxygenase Activating Protein / soluble epoxide hydrolase
Schlagwörter (GND)Entzündung / Tandem-Reaktion / Molekulardesign / Bindestelle
URNurn:nbn:at:at-ubi:1-958 Persistent Identifier (URN)
Zugriffsbeschränkung
 Das Werk ist frei verfügbar
Dateien
Molecular modeling and computational investigation of targets within the inflammatory cascade [17.89 mb]
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Nachweis
Klassifikation
Zusammenfassung (Deutsch)

Diese Dissertation wurde im Zuge des FWF Projektes “Drugs from Nature Targeting Inflammation” (Antiinflammatorische Wirkstoffe aus der Natur)durchgeführt. Ziel der Arbeit war es, Computermodelle für diverse antiinflammatorische Targets zu entwickeln,zu validieren und für die Suche nach aktiven Naturstoffen zur Verfügung zu stellen. Um dieses Ziel zu erreichen wurden Modelle für die folgenden Targets erstellt: Cyclooxygenase (COX) 1 and 2, Soluble Epoxide Hydrolase (sEH), Liver X Receptor (LXR), und 5-lipoxygenase activating protein (FLAP). Zusätzlich wurden mit Methoden wir Docking und MD-Simulation Bindemode für aktive Substanzen in LXR, 5-Lipoxygenase (5-LOX), und indoleamine 2,3 dioxygenase (IDO) vorgeschlagen.Die virtuell vorhergesagten Substanzen wurden in den Laboren unserer Projektpartner experimentell auf ihre Aktvität am isolierten Target gestestet. Wir waren in der Lage zahlreiche computerchemische Methoden erfolgreich für prospektives virtuelles Screening anzuwenden und damit diverse neue aktive Substanzen zu identifizieren und bis dato unbekannte Bindemodi vorzuschlagen.

Zusammenfassung (Englisch)

This thesis work was conducted within the Austrian Science Fund (FWF) project “Drugs from Nature Targeting Inflammation”. The overall aim of this work was to develop, validate and provide computational models to find new anti-inflammatory drugs from nature and to explain their mechanism of action.To reach this goal, pharmacophore and shape-based models were designed for different targets involved in inflammation: Cyclooxygenase (COX) 1 and 2, soluble epoxide hydrolase (sEH), the liver X receptor (LXR), and 5-lipoxygenase activating protein (FLAP). Furthermore, other computational methods such as docking, MD-simulation were used to analyze binding modes within the LXR, 5-Lipoxygenase (5-LOX), and indoleamine 2,3 dioxygenase (IDO).Virtually predicted compounds were tested in the laboratories of our project partners for their activity on the isolated targets.Overall, we successfully employed a variety of computational methods for prospective virtual screening and to analyze binding modes and propose previously unknown mechanisms of action.